有機肥品種繁多，有傳統有機肥，綠肥、生物有機肥等等，不同的品種鑒別的方法也不同。

一、傳統有機肥。

傳統有機肥成分以畜禽糞便做為主要原料，經過發酵、腐熟、脫水、粉碎等工藝后直接銷售，這一類有機肥質量的好壞非常難以鑒別。專業的鑒別主要是鑒別肥料的有機質含量，需要使用專業儀器經過多套工藝才能檢測出有機質以及營養成分的含量。

如果自己使用有一個很直接的鑒別方法，那就是一摸、二看、三聞；因為不同種類的畜禽糞有著不同的色澤和不同的味道，比如說用羊糞做成的有機肥顏色淡黑色。有很濃的羊騷氣，抓在手中有一種很柔和的感覺，如果色澤較淺、抓在手中感覺比較沉、羊騷氣味道較淡，那就證明肥料里面摻入了較多的土壤，同理，其它禽畜糞便有機肥都可以使用這種方法鑒別。

二、綠肥。

綠肥包括作物秸稈腐熟發酵而成的肥料，也包括油菜籽下腳料、芝麻餅、豆粕肥、玉米渣等作物的工業提取物下腳料。這種廢料經過工廠加工后都有一種淡淡的作物清香，同樣可以通過摸、看、聞來鑒別質量的好壞。比如說豆粕肥，豆粕肥抓在手中慢慢揉搓會有一種油油的感覺，看起來顏色淡黃，聞起來有一種豆油的清香，如果沒有那種油油的感覺和豆油的清香那就證明里面也摻入了其他的雜質，比如豆秸粉摻的較多，色澤會是暗黃色的，不會是淡黃色的。

三、生物菌有機肥。

植物生物菌有機肥主要看的主要是生物菌含量的高低，但是這用肉眼是看不出來的，目前市場上有機菌肥品種紛多，質量也是魚龍混雜，生物菌肥是指有活的微生物的肥料，主要功能是提供和活化土壤養分，產生和促進作物生長活性物質，促進有機肥料的腐熟，改善農產品品質，提高作物抗逆能力，生物菌肥主要是看菌而不是看肥，但是市場上很多生物菌肥都是以普通有機肥冒充的；生物菌肥的含量一般有0.2億、1.5億、2億等幾個標準，不同的含量價格也不同，所以在購買時要看好包裝，不能貪便宜，比如說有的菌肥標明活性菌含量2億，銷售價格卻只有人家0.2億含量的價格，那么你就應該考慮它的質量是否存在問題了。

生物菌肥真假的鑒別只能從包裝、菌種含量和種類多少（每一種生物菌肥都不可能是單一菌種，因為單一菌種存活率非常低）、手感、和使用效果上來判斷，包裝是否正規、是否有農業部的肥料登記證（生物菌肥沒有省級以下的登記證）、手感是否干爽色澤是否純正（生物菌肥對汗水來能夠要求較高），抓在手有潮濕感能攥成團以及干燥成灰的都不是真正的生物菌肥；對比試驗，在購買有機肥時選擇不同廠家相同含量的肥料進行對比，經過兩年連續使用后選擇效果好的。