商品有機肥能不能得到農民群眾的喜歡，其實主要就是兩個方面的問題，第一是質量問題，第二是經濟效益問題。

就質量問題而言，農戶自產的有機肥一般都是以人畜的糞便為原材料，但是商家所生產的有機肥填料復雜，肥力有時不如自產的有機肥效果好，這導致很多農戶對商品有機肥并不信任。

經濟效益方面，有機肥的作用在一定程度上是保護土壤，屬于一種長期的土壤保護措施，但是就當期來說，對于農作物產量的增產效果遠遠沒有化肥來的實在，所以就短期經濟效益來看，有機肥并不具備優勢。而且現在大田作物的種植效益較為低下，每畝地僅僅只有幾百塊錢的收益，農戶很難有興趣去實施有機肥改良土壤。

但是從長遠的發展來看，由于長期大量施用化肥所帶來農業面源污染和土壤板結等問題，在政府政策的調控之下，我國化肥施用量短期內會趨于平穩然后下降，而出于對綠色可持續農業的追求，以及在規范有機肥生產廠家、提高農民種植收益的前提下，農戶對于有機肥的認可程度還是會越來越高。