在農村，農民自己動手制造生物有機肥是非常可行的，既節省了大量購物生物菌有機肥，節省農業生產開支，提高經濟效益，又為農村變廢為寶，消化了大量的農業廢棄物，保護了環境，維護了生態。是農村生態環境保護的好方法。農民自己動手制造生物有機菌肥有兩種方法。

第一種方法，自然方法。這種方法是沿襲傳統漚肥方法。選將農作物秸稈切碎或粉碎，和家禽家畜糞便混合堆制，讓生物熱自然發酵發熱，消滅秸稈和糞便上的有害病菌害蟲。可以臺式高堆堆制發酵，或者深坑發酵。大約需要1.5個月至2個月，可以發酵腐爛熟透。

第二種方法，是購買生物菌肥接種制作。這種方法需要一定的生物菌肥投資。為經濟，少投資，多受益的觀念，先將粉碎的秸稈和家禽家畜糞便混合高堆發酵后散熱，按1斤生物菌肥混合100斤有機肥，混合攪拌均勻接種，再堆成小堆發菌，15～20天后可以使用。堆放時間不能過長，避免氨態氮肥損失。購買生物菌肥種類很多，可以依據實際自由挑選，如根瘤菌肥、固氮菌肥、解磷微生物菌肥、硅酸鹽細菌類肥、抗生菌肥、光合細菌肥等等為種肥。

總之，農民自制生物有機肥，既充分利用農業廢棄物，又節省了農業投資，還提高了肥效。