生物有機肥和生物菌劑同屬于微生物肥的范疇，不過他們的側重點不一樣，咱們來看一下：國家標準規定的微生物菌肥分以下3種：

一、微生物菌劑，執行標準：GB20287-2006，主要技術指標就是菌的含量，從2億/克到幾百億不等，對有機質和氮磷鉀沒有要求。

二、生物有機肥，執行標準：NY884-2012，主要技術指標：菌0.2億以上，有機質40%以上，對氮磷鉀沒有要求。

三、復合微生物肥料，執行標準：NY/T798-2004，主要技術指標：菌0.2億以上，有機質20%以上，氮磷鉀6%以上。

從國家標準可以看出：生物有機肥側重的是有機質，通俗來說就是含菌的有機肥，在有機肥里面添加有益菌而已，最終中決定效果的主要還是有機質，如果菌的含量高還好一些，如果只有0.2億/克，那還是當做有機肥來用吧：要知道：每克肥沃的土壤最少含有25億個細菌、40萬個真菌、還有藻類和原生動物，0.2億施入土壤，杯水車薪。

而生物菌劑的直接指標就是菌的含量，菌的含量從幾億到幾百億不等，有利于增加土壤有益菌的種群優勢，這只是其一；其二，生物菌是咱們肉眼看不到的，我們看到的其實是菌的載體，而生產廠家選擇菌的載體多會選擇黃腐酸鉀、氨基酸、腐植酸，或者直接選擇有機肥作為載體，既保障了有益菌的活性，又增加了土壤有機質的含量：其三：有機肥施入土壤，是不能直接吸收的，需要大量的有益菌分解成小分子有機物才能吸收，分解過程中并大量的植物內源激素，刺激植物生長。

從實際有益菌的數量和活性以及實際應用效果來看，微生物菌劑要比生物有機肥效果更好，不過大量的有益菌的投入也需要大量有機肥的投入，二者相輔相成，互相依存，如果微生物菌劑含有機質很少，還要大量投入有機肥的，選擇一款有機質含量高的生物菌劑還是比較合理的。